Модифікація C-123J була спеціалізованою версією - загалом було переобладнано 10 одиниць. Жоден літак цієї конкретної модифікації J наразі не літає.
Кілька екземплярів цієї рідкісної модифікації зберігаються в музеях, переважно в США (оскільки вони використовувалися в арктичних регіонах Аляски). Найвизначніші місця, де можна побачити C-123J: Музей транспорту та промисловості Аляски (Васілла, Аляска, США): У цьому музеї представлений один з арктичних літаків C-123J (бортовий номер 56-4395). Раніше він був розміщений на авіабазі Національної гвардії Куліс. Об'єднана база Елмендорф-Річардсон (Анкоридж, Аляска, США): Ще один літак цієї серії представлений на статичній експозиції на базі ВПС.