Siebel Si 204A та Si 204D були транспортними та навчальними версіями двомоторного літака, побудованого для Lufthansa та головним чином для Люфтваффе. Під час війни також був створений навчальний варіант бомбардувальника, який також міг використовуватися як нічний бомбардувальник. Він отримав позначення Si 204E і випускався у двох прототипах і невеликій серії Si 204E-0. Його використовували в боях для нічних рейдів, у тому числі проти Словацького національного повстання. Після війни виробництво продовжилося в Чехословаччині. Aera C-3B, як ці літаки називали в Чехословаччині, становили основу авіаційних сил бомбардувальників до поставки радянських реактивних бомбардувальників у 1955 році.
